1、表示原因时意义上有细微的差别

「なぜ」强调单纯的原因，而「どうして」是对要问的东西，情况有所不理解，或者说不希望询问的情况发生的心情，含有”怎么会这样的””怎么会变成这个样子的”的意思。

例子：

（1）你昨天请假在家里休息，今天你的老板在办公室里碰到你，他就会问你：

なぜ昨日休んだのか？

这时「なぜ」表示的只是单纯的原因，意思就是你昨天为什么请假啊？（是不是身体不舒服啊？还是家里有急事啊？）

（2）如果你的老板问你：

どうして昨日休んだのか？

这个时候的意思就是说，你昨天怎么请假了啦？（言下之意就是，现在项目这么忙人手又不够，怎么这么点小事情你就随便请假了啦？！）此时你就要小心，你的老板可能已经发火了。。。

2、「どうして」还有一个用法就是”怎么办，如何”的意思。

如：これからどうして暮らしていこうか。（今后的日子要怎么过呀？）

此时，可以把「どうして」看成是「どうする」的连用型变形。

3、语感上的区别

「なぜ」是书面性的用语，显得比较正重；「どうして」比较口语化，给人一种草率、马虎的感觉（很难对比自己身份高的人使用）。